事业单位聘用合同是否有违约金，首先看其他法律、行政法规或国务院有无规定，有规定的，按该规定执行；没有相应规定的，应当适用《劳动合同法》。

事业单位聘用合同虽然与普通的劳动合同有所区别，主要是因为事业单位的性质是属于国家公益的。

根据《劳动合同法》第96条规定：事业单位与实行聘用制的工作人员订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，法律、行政法规或者国务院另有规定的，依照其规定；未作规定的，依照本法有关规定执行。