上市公司非流通股股份转让程序如下：

1、股份持有人向结算公司提出查询拟转让股份的申请；

2、结算公司进行形式审核，符合要求的，对相应股份予以查询和临时保管，并出具股份证明文件和临时保管确认函；

3、达成股权转让协议；

4、股份转让双方向证券交易所申请确认其股份转让的合规性；

5、证券交易所对转让申请材料进行形式审核，自受理股份转让确认申请后的三个工作日内做出是否予以确认的决定；

6、向结算公司申请办理股份转让过户及股份性质变更登记手续；

7、解除临时保管；

8、其他事项。