监视居住期满后的处理程序是：应当由办案机关作出解除或撤销监视居住的决定，具体程序为办案人员提出意见，部门负责人审查，检察长或公安局长决定后，通知办案机关，并将解除决定书送达给嫌疑人。

【法律依据】根据《刑事诉讼法》第七十七条，人民法院、人民检察院和公安机关对犯罪嫌疑人、被告人取保候审最长不得超过十二个月，监视居住最长不得超过六个月。