处理方式为，股东可以依据分立协议约定持有股权和承担债权债务。但投票反对分立的股东可以请求公司按照合理价格收购其股权。
【法律依据】
《公司法》第七十三条，依照本法第七十一条、第七十二条转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。对公司章程的该项修改不需再由股东会表决。