有下列职能：

1.监督职能。医院内部审计监督就是监察和督促医院内部人员在其授权范围内有效地履行其职责，以保证医院的各项活动在符合医院内部的方针、政策、程序、政府的法律条例以及一般公认的管理原则的正常轨道上运行。

2.评价职能。

3.控制职能。控制职能是指内部审计作为一种管理控制，通过医院审计人员独立的检查和评价活动，衡量和评价其他内部控制的适当性和有效性的功能。

4.服务职能。

【法律依据】

《医疗机构管理条例》第5条，国务院卫生行政部门负责全国医疗机构的监督管理工作。县级以上地方人民政府卫生行政部门负责本行政区域内医疗机构的监督管理工作。中国人民解放军卫生主管部门依照本条例和国家有关规定，对军队的医疗机构实施监督管理。