在协议离婚时，双方可以自愿约定财产分割方式，包括一方净身出户的情况。为了保证这份协议的合法性和有效性，双方可以选择到公证机构进行公证。

公证是一种特殊的法律程序，通过公证机构的认证，可以让法律文件变得更加具有法律效力。

但需要注意的是，公证并不能保证协议内容的绝对合法性或有效性。如果协议内容违反了法律的强制性规定或公序良俗，或者存在其他无效情形，那么即使经过了公证，该协议也可能被法院认定为无效。因此，在协议离婚时，双方应该充分了解相关法律法规和政策，确保协议内容的合法性和有效性。同时，如果涉及到复杂的财产分割问题，建议咨询专业律师的意见。

法律依据

《《中华人民共和国公证法》》第十一条 根据自然人、法人或者其他组织的申请，公证机构办理下列公证事项: （一）合同； （二）继承； （三）委托、声明、赠与、遗嘱； （四）财产分割； （五）招标投标、拍卖； （六）婚姻状况、亲属关系、收养关系； （七）出生、生存、死亡、身份、经历、学历、学位、职务、职称、有无违法犯罪记录； （八）公司章程； （九）保全证据； （十）文书上的签名、印鉴、日期，文书的副本、影印本与原本相符； （十一）自然人、法人或者其他组织自愿申请办理的其他公证事项。 法律、行政法规规定应当公证的事项，有关自然人、法人或者其他组织应当向公证机构申请办理公证。

《《中华人民共和国公证法》》第十三条 公证机构不得有下列行为: （一）为不真实、不合法的事项出具公证书； （二）毁损、篡改公证文书或者公证档案； （三）以诋毁其他公证机构、公证员或者支付回扣、佣金等不正当手段争揽公证业务； （四）泄露在执业活动中知悉的国家秘密、商业秘密或者个人隐私； （五）违反规定的收费标准收取公证费； （六）法律、法规、国务院司法行政部门规定禁止的其他行为。