建筑合同被确认无效后分以下情况分别处理：
1、施工合同订立后尚未履行前被确认无效
建设工程施工合同在尚未履行前被确认无效的，双方当事人均不能再继续履行。若一方因准备履行合同有损失，则按照双方导致合同无效的过错程度进行赔偿。
2、建设工程施工合同所约定的工程已经开工但尚未完工时被确认无效
一是应当立即停止履行。
二是若已完工程质量验收合格，发包人应参照无效合同与承包人结算并付款;若已完工程质量验收不合格且无法修复，则承包人应该予以拆除，并向发包人返还已付工程款。
三是有过错的一方应当赔偿对方在准备签订、签订合同、履行合同支出的费用，包括直接费用和间接费用;双方都有过错的，按过错大小各自承担相应赔偿责任。