二手房合同纠纷作为民事纠纷，可以通过协商或者诉讼的方式予以处理。
所谓协商处理，就是二手房买卖合同的当事人对合同中有争议的部分进行协商，从而对原合同中规定的或者没有规定的内容进行修改、删除和增加。当事人按照协商后的内容履行各自的权利义务。
二手房买卖纠纷的协商处理，可以理解为把先前的二手房合同作废掉，然后经过协商后再签订新的合同。协商处理二手房纠纷的优点在于，减少了当事人的成本，有利于纠纷的迅速解决。