法定代表人以法人的名义在合同等文件上签字，但未加盖法人印章的情况下，除非当事人对此另有约定，否则应认定为合同有效，理由如下：
首先，根据《民法通则》规定，法定代表人是代表法人行使职权的负责人，其以法人名义从事的经营活动，给他人造成经济损失的，企业法人应当承担民事责任。
其次，法定代表人是由法人的设立机关或股东（大）会、董事会确定的。例如，有限公司的法定代表人由董事长、执行董事或经理担任，而这些人选实际上是由持有表决权优势的股东决定的。也就是说，法定代表人行为是法人单位实际控制人意志的体现，相应地，其行为后果也应由法人承担。
法律依据：
《合同法》第三十二条，当事人采用合同书形式订立合同的，自双方当事人签字或者盖章时合同成立。