公司专用章和公司合同章的效力有什么区别，从法律上说，公司公章与公司合同专用章在合同签署的效力方面没有差异，公司之所以在公章之外，主要原因是因为公司公章与公司合同专用章在使用与管理上存在区别，具体包括：
1.二者的管理部门不同。公司合同专用章的管理部门一般为法律部门，公司公章的管理部门一般为公司的综合管理部门。
2.用途范围及效力不同。公司合同专用章专用于合同的签订，其效力仅限于合同签订。公章则具有代表公司的功能，其效力除了合同的签订以外，还可涉及及于公司一切事务，如文件、通知及证明等，具有行政管理作用。
法律依据：
《合同法》第三十二条
当事人采用合同书形式订立合同的，自双方当事人签字或者盖章时合同成立。