保证合同的生效时间是在双方订立之际生效。
借款合同纠纷中的保证，主要有三种情况：一是第三人与贷款人签订保证合同。保证合同一经签订即生效；二是第三人和贷款人、借款人共同签订担保贷款合同。担保贷款合同中有保证条款，或虽无保证条款，但第三人在“保证人”栏目内签名或者盖章，保证合同也即告成立并生效。三是担保人单独出具保证书，这是一种比较常见的情况。最为典型的，是第三人在贷款人出具的格式化的“不可撤销保证书”上签名或盖章并交回贷款人。除此以外，第三人出具的具有保证性质的书面文件，包括信函、传真等，也属于保证书的范围。在这种情况下，只要贷款人没有明确表示拒绝，都应认定保证合同成立并生效。可见，保证是诺成性法律行为，保证合同一经订立即告生效。
法律依据：
《合同法》第一百四十条标的物在订立合同之前已为买受人占有的，合同生效的时间为交付时间。