个人申请劳动仲裁败诉后果是不会因败诉而承担义务，只是个人权益受不到保护。申请劳动仲裁是劳动者的合法权利。不会因为权利的行使而承担赔偿责任。如果不是法律规定的一裁终局的事项，可以继续向人民法院提起诉讼以维护自己的劳动权益。当然，如果没有劳动争议，而采取捏造事实的方法，申请劳动仲裁，意图使用用人单位遭受损失的，应当承担侵权的赔偿责任。
根据《劳动合同法》及《劳动争议调解仲裁法》规定，劳动仲裁是解决公司与员工之间发生劳动争议的合法途径。该劳动仲裁裁决结果并不属于行政处罚行为，劳动仲裁案件本身的客观存在并不会影响公司的上市。劳动仲裁的申请事项，大部分与经济相关，并且除了正常应当支付给劳动者的费用之外，可能还会产生经济补偿金、赔偿金或者双倍工资之类的，具有惩罚性的费用支出；如果用人单位败诉，最直接的影响就是，需要付出更多的经济成本。劳动纠纷发生后，对企业的形象也是一个很负面的影响，如果网络发达，发生劳动纠纷后，劳动者可能在网上各种渠道发布企业的负面消息，这对企业以后的用人、企业信用，都会造成不可估量的影响；建议企业规范管理，发生劳动纠纷后，能协商处理的，尽量协商处理。您清楚了吗？
法律依据：《劳动争议调解仲裁法》第四十七条 下列劳动争议，除本法另有规定的外，仲裁裁决为终局裁决，裁决书自作出之日起发生法律效力：
　　（一）追索劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金，不超过当地月最低工资标准十二个月金额的争议；
　　（二）因执行国家的劳动标准在工作时间、休息休假、社会保险等方面发生的争议。