根据我国法律的规定,员工不能卖掉公司的厂房。因为厂房是属于公司所有的,即便是公司没有按照法律规定给与员工发放工资和相应的赔偿,员工也没有权利私下出售公司的厂房。
而且厂房的出售是需要有相关的手续办理,员工没有相应的产权,自然也就无法出售。