建筑工程质保金的扣除：

1、逐次扣留，即发包人在支付工程进度款时按比例逐次扣留；

2、一次性扣留，即发包人在工程竣工结算时一次性扣留质量保证金。

【法律依据】

《建设工程质量保证金管理暂行办法》第三条，发包人应当在招标文件中明确保证金预留、返还等内容，并与承包人在合同条款中对涉及保证金的下列事项进行约定：

（一）保证金预留、返还方式；

（二）保证金预留比例、期限；

（三）保证金是否计付利息，如计付利息，利息的计算方式；

（四）缺陷责任期的期限及计算方式；

（五）保证金预留、返还及工程维修质量、费用等争议的处理程序；

（六）缺陷责任期内出现缺陷的索赔方式；

（七）逾期返还保证金的违约金支付办法及违约责任。