根据《破产法》《审计法》等法律法规的规定，公司破产清算审计工作流程如下：

1、企业资产状况的核实。

2、企业负债状况的审定。

3、企业所有者权益的审定根据上述资产、负债状况，对调整后的未分配利润等确认企业的所有者权益。

4、对下述事项应进一步落实。

（1）超过3年不能收回的应收款数额及虽未超过3年，但确实无法收回的应收款数额。

（2）取得房屋、土地的所有权及使用权证，明确产权归属，进而确定其中破产财产和担保财产的数额。

（3）用作抵押财产的有关资料和财产数额。

（4）用于企业福利性设施的数额及相关资料。

5、按审计法规要求还应核实的项目进行核实。