公司股东与法人纠纷导致破产的处理方式为：将各自的负责内容梳理清楚；进入破产清算程序；

成立清算组；破产企业的全面接管；破产企业的财务审计；破产财产的清理、清算；制定破产财产分配方案等。

【法律依据】《公司法》第一百八十三条规定，公司因本法第一百八十条第（一）项、第（二）项、第（四）项、第（五）项规定而解散的，应当在解散事由出现之日起十五日内成立清算组，开始清算。

有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成。

逾期不成立清算组进行清算的，债权人可以申请人民法院指定有关人员组成清算组进行清算。人民法院应当受理该申请，并及时组织清算组进行清算。