可以调解合同纠纷的部门：

1、行政调解部门主要是有关行政领导部门和业务主管部门。

2、仲裁调解部门主要是仲裁机构。合同当事人在发生纠纷时，在仲裁机构主持下，根据自愿协商，互谅互让的原则，达成解决合同纠纷的协议。

3、法院调解。

【法律依据】

《中华人民共和国合同法》第一百二十八条，当事人可以通过和解或者调解解决合同争议。当事人不愿和解、调解或者和解、调解不成的，可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。涉外合同的当事人可以根据仲裁协议向中国仲裁机构或者其他仲裁机构申请仲裁。当事人没有订立仲裁协议或者仲裁协议无效的，可以向人民法院起诉。当事人应当履行发生法律效力的判决、仲裁裁决、调解书;拒不履行的，对方可以请求人民法院执行。