工资是劳动的对价：只要员工实际提供了劳动，无论其最终以何种方式离开公司，都有权获得相应的劳动报酬。这是《中华人民共和国劳动法》第五十条所确立的基本原则，该法条规定工资应当按时足额支付，不得克扣或无故拖欠。

解除合同时应结清工资：根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止时一次性付清劳动者工资。员工自动离职，实质上也是一种单方解除劳动合同的行为，公司应在劳动关系结束时结清工资。

扣发工资并非合法维权途径：如果员工自动离职（如未提前通知）给公司造成了实际损失（例如，导致工作交接不畅产生损失），公司应通过法律途径（如劳动仲裁、诉讼）向员工主张赔偿，而不能直接以扣发其上月或以往工资的方式来“抵偿”。这两种法律关系是独立的。

您可以按以下步骤逐步维权：

收集证据：这是所有后续步骤的基础。请务必保存好能证明劳动关系和工资标准的证据，例如：劳动合同、工作证、考勤记录、工资条、银行转账记录、盖有公章的文件、与负责人沟通的微信/短信/邮件记录等。

与公司协商：首先尝试与公司的人力资源部门或负责人进行正式沟通，出示您的证据，明确指出其扣发工资的行为违法，要求限期支付。

向劳动监察大队投诉：如果协商无效，您可以携带证据到公司所在地的“劳动保障监察大队”进行投诉。劳动监察部门会进行调查，并有权责令公司限期支付您的工资。这是一种较为快捷的行政解决途径。

申请劳动仲裁：如果投诉后公司仍不支付，或者您想一并主张其他权益（如经济补偿、赔偿金等），您可以在法定时效内（通常为知道权利被侵害之日起一年内）向公司所在地的“劳动争议仲裁委员会”申请仲裁。仲裁裁决具有法律效力。

向人民法院提起诉讼：如果对仲裁裁决不服，任何一方都可以在收到裁决书之日起15日内向人民法院提起诉讼。如果仲裁裁决生效后公司拒不履行，您可以向人民法院申请强制执行。

法律依据

《《中华人民共和国劳动法》》第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

《《工资支付暂行规定》》第九条 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资