可以。公司在破产清算阶段，法人地位仍然存续。根据最高人民法院《民事诉讼法司法解释》第六十四条：“企业法人解散的，依法清算并注销前，以该企业法人为当事人”。如果劳动争议发生时，用人单位进入破产清算，那么劳动者仍可在仲裁时将其列为被申请人，清算组可以代表破产企业参加诉讼和仲裁活动。如果已经清算完毕，那么劳动者可以将接收清算资产的股东列为被申请人申请仲裁。