合同违约金在货款扣除的条件是：

1、必须是违约金过分高于或低于违约造成的损失；

2、必须当事人提出请求；

3、违约金数额高低的比较标准及调整标准均是违约造成的损失。

【法律依据】根据《合同法》第一百一十四条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。