物流企业在签订运输合同时应注意的问题如下：
1、承运人不得拒绝托运人通常、合理的运输要求；
2、要承运人不得拒绝托运人通常、合理的运输要求；
3、要明确归责原则；等等。
【法律依据】
《合同法》第二百八十八条规定，运输合同是承运人将旅客或者货物从起运地点运输到约定地点，旅客、托运人或者收货人支付票款或者运输费用的合同。